Нокдаун гена

У этого термина существуют и другие значения, см. нокдаун.

Нокдаун гена (англ. Gene knockdown) — методика, позволяющая снизить экспрессию одного или нескольких генов при помощи изменения соответствующей последовательности нуклеотидов, либо при помощи короткого олигонуклеотида, комплементарного соответствующей молекуле мРНК. В случае, когда изменяется последовательность гена, организм называют нокаутным по данному гену (подробнее см. в статье нокаут гена). В случае использования коротких олигонуклеотидов, комплементарных соответствующим мРНК или связывающимися с последовательностью нуклеотидов в ДНК, нокдаун гена приводит к временному изменению параметров экспрессии гена, без внесения изменений в структуру хромосом и последовательности ДНК гена.

В случае кратковременного нокдауна, связывание олигонуклеотида с геном или транскриптами, понижает экспрессию из-за блокировки транскрипции, трансляции или деградации мРНК (например, по пути РНК-интерференции), также может нарушаться сплайсинг пре-мРНК.^[1][2] Исследователи изучают влияние выключения гена или снижения его экспрессии на фенотип организма и сравнивают с нормальными особями. Кратковременные нокдауны генов часто используют в биологии развития, так как олигонуклеотиды легко могут быть введены в зиготу и будут попадать во все дочерние клетки в ходе эмбрионального развития.^[3]

Примечания

1. ↑ Summerton, J (2007). «Morpholino, siRNA, and S-DNA Compared: Impact of Structure and Mechanism of Action on Off-Target Effects and Sequence Specificity» (Pubmed). Med Chem. 7 (7): 651–660.
2. ↑ Summerton, J (1999). «Morpholino Antisense Oligomers: The Case for an RNase-H Independent Structural Type» (Pubmed). Biochimica et Biophysica Acta 1489 (1): 141–58. PMID 10807004.
3. ↑ Nasevicius, A; Ekker SC (2000). «Effective targeted gene 'knockdown' in zebrafish» (Pubmed). Nature Genetics 26 (2): 216–20. DOI:10.1038/79951. PMID 11017081.

См. также

• Нокаут гена