- Неравновесное сцепление генов
-
Неравновесное cцепление генов (англ. linkage disequilibrium) — неслучайное распределение частот аллелей разных локусов, которое может быть обусловлено не только тесным генетическим сцеплением генов, но и наличием адаптивного преимущества конкретной комбинации аллелей, частота которой соответственно возрастает в сравнении с частотой, ожидаемой при случайном распределении.
Программы для вычисления LD
- LiAn - Linkage Analysis 3.5 (sIa) (online)
- Arlequin 3.11 (p-values, D, D', r², χ²) (Windows)
- LinkDos on the Web (Δ, D, D') (online)
- MultiLocus 1.3b (Ia, rd) (Windows, MacOS)
- LDA - Linkage Disequilibrium Analyzer 1.0 (D', r², χ²) (Java, Windows, MacOS)
- MIDAS - Multiallelic Interallelic Disequilibrium Analysis Software 1.0 (Python, Windows, Linux)
Визуализация
- JLIN - Java based Linkage Disequilibrium plotter 1.6.0 (Java)
- GOLD - Graphical Overview of Linkage Disequilibrium (Windows)
Ссылки
- Mueller J.C. Linkage disequilibrium for different scales and applications. Brief Bioinform. 2004, 5:355-364.
- A Compilation of Some Available Software for Linkage Disequilibrium Analysis
Для улучшения этой статьи желательно?: - Дополнить статью (статья слишком короткая либо содержит лишь словарное определение).
- Найти и оформить в виде сносок ссылки на авторитетные источники, подтверждающие написанное.
Категория:- Генетика
Wikimedia Foundation. 2010.